论文生物信息学分析的计算机环境最优配置是关于生物信息学方面的的相关大学硕士和相关本科毕业论文以及相关生物信息学论文开题报告范文和职称论文写作参考文献资料下载。
摘 要：生物信息学是现代生物学、计算机科学和数学的交叉学科,主要通过数学方法借助计算机对生物数据进行科学分析,相对于传统实验方法更高效、更具有逻辑性.本文主要以Linux系统的衍生系统——Ubuntu系统为分析系统,介绍如何配置最适合于生物信息学分析的计算机环境.
关键词：生物信息学；分析环境配置；Ubuntu系统；生物数据分析
生物信息学是研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科,是生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科.它通过综合利用生物学,计算机科学和信息技术而揭示繁杂的生物数据所蕴含的生物学意义.ubuntu系统基于Debian发行版和GNOME桌面环境.它的目标在于为用户提供一个最新的、相对稳定的主要由自由软件构成的操作系统,可免费使用,并带有社团及专业支持.本文介绍了如何借助Ubuntu系统,配置较优的生物信息学分析环境.
1 生物信息分析环境的配置
1.1 安装win+Ubuntu双系统
第一步：进入程序员管理空间Win + X,在管理磁盘栏目下面选择二进制空间完好且较大的空间进行分配.将分配空间进行二进制码压缩,选择60*1024MB的二进制空间压缩.然后产生黑色可用空间.
第二步：同样在程序员空间下进入电源选项,修改原来在windows系统下的電源功能.将原来的默认值修改为关闭快速启动的值,保证在安装Ubuntu系统后的grub正常运行.最后使用wq方式保存当前安装.也可以进入DOS环境编译修改win的设置.
第三步：在DOS环境中restart个人终端.通过快捷键进入bios空间.进入方式依据PC型号不同而不同,进入系统bios后将U盘启动调整为最优先项目,设置后再次restart切换进入ubuntu安装界面.进入ubuntu主界面后在U盘中找到刻录的ISO文件双击打开ubuntu安装文件,完成默认设置.[1]
第四步：在Ubuntu下创建新的二进制空间,以add方式创建四个新的分区空间,分区空间以之前分配的60*1024MB为基准.首先将10*1024MB分配为基础二进制空间,又在基础二进制空间上,添加20*1024MB作为空间的起始部分.通过布尔转换设置空间的日志及逻辑分区,将剩下的空间全部作为衔接双系统的swap逻辑空间.
切换回windows系统设置引导内容,保证两个系统在开机中有选择性进入栏目.在DOS下进入/boot编译设置,将引导路径设置为由windows下主导的路径.restart终端,进入Win10下的EasyBCD完成最后的引导设置.在进入add新条目栏目下选择Linux/BSD操作系统,在“驱动器”栏目选择接近200M的Linux分区,点添加条目.
1.2 修改gcc
为了将Ubuntu系统配置为适合生物信息分析系统,方便编译生物信息分析软件,需要修改gcc,通常计算机内置gcc为以下：
Lrwx 1 root root 7 2018.02.18 22：45：31 /usr/bin/ect/gcc>gc.6
rwxrxrx 1 root root 2215423 2018.02.18 22：45：31 /usr/bin/etc/gc.4
rwxx 1 root root 214369 2018.02.18 22：45：31 /usr/bin/etc/gc.5
rwxrxrx 1 root root 336547 2018.02.18 22：45：31 /usr/bin/etc/gc.6
由上面显示可以看出默认安装的是gc.6,现在来改成gc.4：
（1）rmdir pgcc-4.6 /usr/bin/etc/gcc.将这个连接的软性设置删除
（2）terminal：sudo rmdir r /usr/bin/etc/gcc & chown /usr/bin/etc/gcc 770
（3）创建一个软连接,指向gc.4[2]
（4）terminal：sudo ln s /usr/bin/etc/gc.4 /usr/bin/etc/gcc
（5）terminal using：gcc v
（6）使用内建 specs
目标：i686linuxgnu
配置为：
../src/configurevwithpkersion等于"wksngbusgkxhjkg/Ubuntu/Linaro4.4.611ubuntu2"withbugurlPATH等于$PATH&file：///usr/share/doc/gc.4/README.Bugsenabl,fortran,objc,objc++prefix等于/usr/shufkgu/kgihgfnue/programsuffix等于4.4/dhiajsd/ighugriuenableshared/dajcunduewithsystemzlib libexecdir等于/usr/lib withoutfdcuekshuf/cbiutgk/lognu/logout/ttext等于posix/PATH：bashrc>>sifhu/ubuntu/clude/c++/4.4libdir等于/usr/lib/longus/ubutnu/usr/bin/etcenableclocale等于gnutdcxxdebugenableobjcgc/snculsi/enabletargets等于all/prefix/disablewerrorwitharch32等于i686withtune等于genericenablechecking等于release/ubuntubuild等于i686linuxgnuhost等于i686linuxgnu target等于i686linuxgnu
总结:本论文可用于生物信息学论文范文参考下载，生物信息学相关论文写作参考研究。
参考文献：
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