论文谷子胁迫诱导型启动子SiRLK35P分离生物信息学分析是关于启动子方面的论文题目、论文提纲、启动子有几种论文开题报告、文献综述、参考文献的相关大学硕士和本科毕业论文。
摘 要：本研究以谷子 “豫谷1号”为材料,结合相关数据库检索,以谷子幼苗提取的基因组DNA为模板,经PCR特异扩增SiRLK35上游1 893 bp调控序列,命名为SiRLK35P.结合PLACE数据库,对SiRLK35P进行生物信息学分析,并对其诱导表达情况进行了预测.结果显示,SiRLK35P中含有ABRELATERD1（ACGT）、GCCCORE（GCCGCC）等多种顺式作用元件,部分元件已知和不同逆境胁迫及应答相关,预测该启动子可能参和谷子胁迫响应,调控下游基因在胁迫等逆境条件下的表达水平,从而对谷子在胁迫下的应答进行调控.该研究为定向改良谷子抗逆特性、培育谷子抗逆新品种提供了候选材料.
关键词：谷子；启动子；SiRLK35P；顺式作用元件；抗逆；品种培育
中图分类号：S515：Q781 文献标识号：A 文章编号：1001-4942（2017）07-0007-05
Abstract Using Yugu 1 as material, a 1 893 bp upstream regulatory sequence of SiRLK35 gene, which named SiRLK35P, was identified by database searching, and was isolated by PCR amplification using genomic DNA of foxtail millet as template. Bioinformatics analysis of SiRLK35P was carried out with PLACE database, and its expression pattern was forecasted. The results showed that several cis-acting elements, such as ABRELATERD1 （ACGT） and GCCCORE （GCCGCC）, existed in SiRLK35P, and parts of them were known to be associated with stress responsive processes, which indicated that SiRLK35P might participate in stress response and regulate the expression levels of downstream genes under stress conditions. This research would provide a candidate material for stress resistance improvement and new variety breeding of foxtail millet.
Keywords Foxtail millet； Promoter； SiRLK35P； Cis-acting element； Stress resistance； Variety cultivation
启动子是一段位于功能基因上游,能结合RNA聚合酶及其他转录因子,从而决定基因转录起始以及表达量的DNA序列.启动子作为基因上游的调控序列,其中的顺式作用元件在基因的转录及时空表达调控方面发挥重要作用[1].对基因启动子的研究,尤其对该序列中所包含的不同调控元件的解析,将有助于预测基因的表达调控模式,为进一步解析基因功能奠定基础.
根据启动子所包含的关键调控元件的种类及功能,结合其下游调控基因的生物特性,植物中启动子通常可分为三类：组成型启动子、组织特异性启动子和胁迫诱导型启动子[2],但同时很多组织特异性启动子和胁迫诱导型启动子也包含组成型启动子[3].其中,胁迫诱导型启动子可对逆境条件如干旱、高盐等非生物胁迫或病虫害等生物胁迫产生响应,从而对基因的转录及表达进行调控[4].
谷子在我国北方种植广泛,是我国传统粮食作物兼战略储备作物.但在国际科学界,其遗传学研究相对落后.2012年,谷子测序工作的完成[5],为解析谷子基因功能及其调控机制提供了新的途径.本项目组在前期研究中发现一个和谷子抗逆相关的类受体蛋白激酶基因SiRLK35[6].本研究拟结合谷子数据库检索分离得到该基因启动子,并通过启动子区作用元件分析,明确该启动子类型,以期为进一步解析SiRLK35基因的功能奠定基础.
1 材料和方法
1.1 材料和试剂
本研究以谷子品种“豫谷1號”为材料.pEASY BLUNT试剂盒、TransStart FastPfu DNA Polymerase试剂盒、2×EasyTaq SuperMix均购于Transgen公司（山东济南雨同生物科技有限公司）；薄型琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒购于GENERAY Biotechnology；高纯质粒小量制备试剂盒购于BioTeke公司（济南承森贸易有限公司）；引物由上海英潍捷基公司合成；其余试剂为进口或国产分析纯.
1.2 基因组DNA提取
将“豫谷1号” 培养3周至三叶期,取其幼苗,使用TPS法提取谷子基因组DNA.
1.3 启动子SiRLK35P的分离
检索国家谷子数据中心（http：//www.setariadb.cn/）,得到SiRLK35基因起始密码子上游1 893 bp序列,作为基因启动子序列,命名为SiRLK35P.使用Primer Premier 5设计引物SiRLK35PS1：TGCTTGTGCGTCTGCGCCGTGTGA、SiRLK35PA1：AACGGTTTATTTGCTTGGAGTACCT.以谷子幼苗基因组DNA为模板,PCR反应体系为：基因组DNA 1 μL、引物SiRLK35PS1、SiRLK35PA1各0.5 μL、TransStart FastPfu DNA Polymerase 1 μL、5×TransStart FastPfu Buffer 4 μL、dNTPs 2 μL,ddH2O补齐到20 μL.反应程序设置如下：94℃ 5 min；94℃ 30 s,57.5℃ 30 s,72℃ 2 min,34个循环；72℃ 10 min.
总结:本文是一篇关于启动子论文范文，可作为相关选题参考,和写作参考文献。
参考文献：
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